氮，蕓豆喜硝態氮肥，氮的供應并不是越多越好，適當施氮有利于增加產量和改善品質，施用過多會導致落花及延遲成熟，影響蕓豆的產量和效益。磷，磷對蕓豆根瘤菌的形成和開花結莢具有重要作用。
缺磷易使蕓豆植株及根瘤菌的生長發育不良，開花結莢數減少，莢果籽粒數少，產量降低。鉀，鉀能明顯影響蕓豆的生長發育和產量的形成，鉀肥供應不足，會使蕓豆減產20%以上。生產上，氮肥用量適當多些，即使鉀施用量少些，一般也不會表現缺鉀癥狀。
鎂，蕓豆易發生缺鎂癥。若土壤中鎂元素不足，從蕓豆播種后1個月起，首先在初生葉，隨著在首片真葉的葉脈間開始黃化褪綠，逐漸向上部葉片發展，大約延續7天，葉片開始脫落，產量降低。鉬，微量元素鉬是固氮酶和硝酸還原酶的重要組成成分，在生理代謝上主要是參與生物固氮，促進植株體的氮、磷營養代謝。